摘要：目的建立高效的焦磷酸测序鉴定临床常见病原菌的方法。方法在细菌16S rRNA的V1及V3可变区两端保守序列设计PCR扩增通用引物及焦磷酸测序引物，PCR扩增后焦磷酸测序测定V1及V3可变区序列，测序结果与数据库比对判断细菌种属。结果在4 h内完成96株细菌的鉴定，所有菌株鉴定结果与常规鉴定结果一致。结论焦磷酸测序技术可以用于临床分离菌株的鉴定，且具有费用相对低廉、高通量、鉴定能力强等优点。